From 8f6d2f9b064010a059dec3a4b490c22b129eec64 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Filippo Rusconi Date: Thu, 6 May 2021 11:42:47 +0200 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Encore=20un=20peu=20structure,=20sans=20pr?= =?UTF-8?q?=C3=A9tention.?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- resume.md | 62 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++-------- 1 file changed, 53 insertions(+), 9 deletions(-) diff --git a/resume.md b/resume.md index 349c77a..a6f1f74 100644 --- a/resume.md +++ b/resume.md @@ -21,15 +21,59 @@ activités de recherche scientifique et de développement logiciel. La plateforme PAPPSO (plateforme...) de spectrométrie de masse pour la biologie est destinée à fournir à ses usagers scientifiques des services complémentaires: en premier lieu, la préparation de l'échantillon biologique, en deuxième lieu, -son analyse par spectrométrie de masse, en deuxième lieu, et enfin la fouille -des données expérimentales obtenues afin de fournir aux usagers des données -d'intérêt biologique immédiatement exploitables. La mise en œuvre des ces trois -services a requis la mise en place d'une infrastructure informatique permettant -1) l'enregistrement des caractéristiques détaillées de chacune des -étapes, 2) le stockage des données et leur transfert sur les postes de travail -des différents intervenants, 3) le traitement des données (fouille des données -et analyses statistiques), 4) le stockage de toutes les données produites dans -un dépôt accessible aux usagers. +son analyse par spectrométrie de masse et enfin la fouille des données +expérimentales obtenues afin de fournir aux usagers des données d'intérêt +biologique immédiatement exploitables. La mise en œuvre des ces trois services a +requis la mise en place d'une infrastructure informatique permettant un traçage +continu de chaque étape avec stockage des paramètres et des résultats à chaque +instant. + +Infrastructure +-------------- + +L'infrastructure informatique dont le socle est un réseau interne au laboratoire +est constituée des élements suivants: + +. +. +. + +Dans ce contexte, l'emploi exclusif de logiciels libres garantit ceci, cela et +encore autre chose. Ainsi, nous limitons la dépendance vis-à-vis d'éditeurs de +logiciels dont les produits ont cet inconvénient et cet autre inconvénient +encore. Le succès de notre démarche est lié à ceci et cela et nous permet de +faire la suite. + +Logiciels métier +---------------- + +- Gestion documentaire (sourcesup, git) + +- Interfaçage instruments (proteowizard, pappsomspp, expérience Bruker) + +- Science à proprement parler (visualisation/fouille des données, explorations + statistiques, production des résultats, mises en oeuvre par notre suite + logicielle) + +Bilans +------ + +Je pense que c'est ici qu'il faut faire la morale en montrant que la morale +colle bien avec efficacité technique et production scientifique + + + + + + +Ainsi, + +1) +l'enregistrement des caractéristiques détaillées de chacune des étapes, 2) le +stockage des données et leur transfert sur les postes de travail des différents +intervenants, 3) le traitement des données (fouille des données et analyses +statistiques), 4) le stockage de toutes les données produites dans un dépôt +accessible aux usagers. 1) Chaque étape du processus analytique est minutieusement documentée et --- dès que possible --- standardisée de manière à nous approcher autant que possible