meta:
  updated: "2023-07-29"
contact:
  name: Samuel ORTION
  email: samuel@ortion.fr
  date_of_birth: "2023-01-21"
  job: Étudiant en bioinformatique
  location:
    address: |
      Appartement B020 Estudines le Parc
      61 Boulevard de l'Yerres
    city: Évry-Courcouronnes
    country: FR
    zip: "91000"
  phone: "+33621580348"
experiences:
  - company: Institut Pasteur
    position: Stage en bioinformatique
    date: July-August 2023
    summary: |
      Au sein de l'équipe Régulation Spatiale des Génomes, j'ai participé au développement d'un bout de code 
      visant à accélérer la reconstruction des cartes de contact Hi-C incomplètes, en échantillonant les positions des reads en se basant sur la distributions des éléments répétées 
      (détectés par RepeatMasker) dans le génome sur lesquels s'alignent les reads. 
  - company: Centre de Recherche en Neurosciences de Lyon
    position: Stage en neurosciences
    date: May-June 2023
    summary: |
      Étude de signaux électrophysiologiques (LFP, respiration, whisking) de rats à l'aide de scripts Python. - company: Natural-Solutions
  - company: Natural-Solutions
    position: Stage d'informatique
    date: Janvier 2022
    summary: |
      Une petite semaine de stage en agence de développement web.
      Participation à la rédaction d'une documentation et d'un bout de script de traitement de la sortie d'un modèle de détection et identification des cris nocturnes d'oiseaux sur spectrogramme.
      Découverte de la méthode Scrum
    website: https://www.natural-solutions.eu/
    tags:
      - docs
      - oiseaux
      - spectrogrammes
      - scrum
profiles:
  - network: Site web
    url: https://samuel.ortion.fr/
  - network: Blog
    url: https://blog.samuel.ortion.fr/
  - network: Pleroma
    url: https://pleroma.s1gm4.eu/samulus
  # - network: Facebook
  #   url: https://facebook.com/samuel.ortion/
  # - network: Twitter
  #   url: https://twitter.com/SAmULuUus/
education:
  - degree: Master Genomics, Informatics and Mathematics for Health and Environment
    date: 2023-2025
    institution: Université d'Évry val d'Essonne - Université Paris-Saclay
    website: https://www.universite-paris-saclay.fr/formation/master/bio-informatique
  - degree: Licence Double Sciences de la Vie - Informatique
    date: 2020-2023
    institution: Université d'Évry val d'Essonne - Université Paris-Saclay
    website: https://www.univ-evry.fr/
    summary: |
      Double cursus en biologie et informatique.
      Validé avec mention bien.
      Participation à l'édition 2023 du hackathon Digitals for Genomics (équipe DeepContact, Institut Pasteur).
      Participations aux éditions 2021 et 2022 de la Nuit de l'Info.
      Participation à l'édition 2023 de la compétition iGEM (équipe iGEM Évry-Paris-Saclay).
  - degree: Baccalauréat Scientifique spécialité Sciences de la Vie et de la Terre mention Européenne Anglais
    date: 2017-2020
    institution: Lycée Notre-Dame, Le Mans (Sarthe)
    summary: |
      Obtention du baccalauréat mention très bien. 
      Participation aux olympiades de la chimie, en terminale (premier aux épreuves départementales en Sarthe en 2020).
      Participation en classe DNL Sciences de la vie et de la terre, au Passeport Recherche, sur le thème du cancer.
skills:
  - name: C
  - name: C++
  - name: Rust
  - name: Python
  - name: R
  - name: Julia
  - name: JavaScript
  - name: Java
  - name: PHP
  - name: SHELL
  - name: Docker
  - name: QEMU/KVM
  - name: LaTeX/LuaLaTeX
  - name: HTML
  - name: CSS
languages:
  - name: Français
    level: Natif
  - name: Anglais
    level: B2
  - name: Allemand
    level: A2
projects:
  - name: OpenGeoGame
    description: |
      Un clone libre de JeuxGeographiques
      Placer une ville de France sur une carte satellite 
    url: https://geo.games.1ib.re/
hobbies:
  - name: Ornithologie
    details: |
      Se promener sur le terrain à la rencontre des piafs 
      et participer ce faisant aux programmes de sciences participatives.
  - name: Photographie naturaliste
    url: https://gallery.samuel.ortion.fr/
  - name: Groupe d'Utilisateur des Logiciels Libres Linux Essonne
    details: Des réunions un samedi sur deux pour discuter GNU/Linux entre autres choses.