Encore un peu structure, sans prétention.
This commit is contained in:
parent
b12835c100
commit
8f6d2f9b06
62
resume.md
62
resume.md
@ -21,15 +21,59 @@ activités de recherche scientifique et de développement logiciel.
|
|||||||
La plateforme PAPPSO (plateforme...) de spectrométrie de masse pour la biologie
|
La plateforme PAPPSO (plateforme...) de spectrométrie de masse pour la biologie
|
||||||
est destinée à fournir à ses usagers scientifiques des services complémentaires:
|
est destinée à fournir à ses usagers scientifiques des services complémentaires:
|
||||||
en premier lieu, la préparation de l'échantillon biologique, en deuxième lieu,
|
en premier lieu, la préparation de l'échantillon biologique, en deuxième lieu,
|
||||||
son analyse par spectrométrie de masse, en deuxième lieu, et enfin la fouille
|
son analyse par spectrométrie de masse et enfin la fouille des données
|
||||||
des données expérimentales obtenues afin de fournir aux usagers des données
|
expérimentales obtenues afin de fournir aux usagers des données d'intérêt
|
||||||
d'intérêt biologique immédiatement exploitables. La mise en œuvre des ces trois
|
biologique immédiatement exploitables. La mise en œuvre des ces trois services a
|
||||||
services a requis la mise en place d'une infrastructure informatique permettant
|
requis la mise en place d'une infrastructure informatique permettant un traçage
|
||||||
1) l'enregistrement des caractéristiques détaillées de chacune des
|
continu de chaque étape avec stockage des paramètres et des résultats à chaque
|
||||||
étapes, 2) le stockage des données et leur transfert sur les postes de travail
|
instant.
|
||||||
des différents intervenants, 3) le traitement des données (fouille des données
|
|
||||||
et analyses statistiques), 4) le stockage de toutes les données produites dans
|
Infrastructure
|
||||||
un dépôt accessible aux usagers.
|
--------------
|
||||||
|
|
||||||
|
L'infrastructure informatique dont le socle est un réseau interne au laboratoire
|
||||||
|
est constituée des élements suivants:
|
||||||
|
|
||||||
|
.
|
||||||
|
.
|
||||||
|
.
|
||||||
|
|
||||||
|
Dans ce contexte, l'emploi exclusif de logiciels libres garantit ceci, cela et
|
||||||
|
encore autre chose. Ainsi, nous limitons la dépendance vis-à-vis d'éditeurs de
|
||||||
|
logiciels dont les produits ont cet inconvénient et cet autre inconvénient
|
||||||
|
encore. Le succès de notre démarche est lié à ceci et cela et nous permet de
|
||||||
|
faire la suite.
|
||||||
|
|
||||||
|
Logiciels métier
|
||||||
|
----------------
|
||||||
|
|
||||||
|
- Gestion documentaire (sourcesup, git)
|
||||||
|
|
||||||
|
- Interfaçage instruments (proteowizard, pappsomspp, expérience Bruker)
|
||||||
|
|
||||||
|
- Science à proprement parler (visualisation/fouille des données, explorations
|
||||||
|
statistiques, production des résultats, mises en oeuvre par notre suite
|
||||||
|
logicielle)
|
||||||
|
|
||||||
|
Bilans
|
||||||
|
------
|
||||||
|
|
||||||
|
Je pense que c'est ici qu'il faut faire la morale en montrant que la morale
|
||||||
|
colle bien avec efficacité technique et production scientifique
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Ainsi,
|
||||||
|
|
||||||
|
1)
|
||||||
|
l'enregistrement des caractéristiques détaillées de chacune des étapes, 2) le
|
||||||
|
stockage des données et leur transfert sur les postes de travail des différents
|
||||||
|
intervenants, 3) le traitement des données (fouille des données et analyses
|
||||||
|
statistiques), 4) le stockage de toutes les données produites dans un dépôt
|
||||||
|
accessible aux usagers.
|
||||||
|
|
||||||
1) Chaque étape du processus analytique est minutieusement documentée et --- dès
|
1) Chaque étape du processus analytique est minutieusement documentée et --- dès
|
||||||
que possible --- standardisée de manière à nous approcher autant que possible
|
que possible --- standardisée de manière à nous approcher autant que possible
|
||||||
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user